Nawet jeśli podczas kontroli NFZ doszło do nieprawidłowości, zebrane dowody mogą być użyte przeciwko podmiotowi leczniczemu w procesie cywilnym o należności z tytułu kontraktu zawartego z funduszem – postanowienie Sądu Najwyższego z 10 marca 2017 r. (sygn. akt III CZP 116/16).